เมื่อเวลา 17.00 น. วันที่ 28 มิ.ย. ที่เต็นท์บริเวณลานคนเมือง หน้าศาลาว่าการกรุงเทพมหานคร หน่วยเลือกตั้งที่ 2 แขวงเสาชิงช้า เขตพระนคร ผู้สื่อข่าวรายงานบรรยากาศหลังปิดหีบลงคะแนนเลือกตั้งว่า เจ้าหน้าที่ประจำหน่วยเลือกตั้งที่ 2 ได้พับเก็บคูหาลงคะแนน และเตรียมพื้นที่สำหรับการปิดหีบเลือกตั้ง ทั้งการเลือกตั้งผู้ว่าฯ กทม. และสมาชิกสภากรุงเทพมหานคร (สก.) เพื่อเริ่มกระบวนการนับคะแนน

โดยการนับคะแนนผู้ว่าฯ กทม. ใช้บัตรเลือกตั้งสีเขียว ซึ่งเจ้าหน้าที่ได้จัดเตรียมตะกร้า 3 ใบ ได้แก่ ตะกร้าสีเขียวสำหรับบัตรดี ตะกร้าสีแดงสำหรับบัตรเสีย และตะกร้าสีฟ้าสำหรับบัตร “ไม่เลือกผู้สมัครใด” เพื่อใช้คัดแยกและขานบัตรก่อนนำลงตะกร้าให้ถูกต้อง ขณะที่การนับคะแนน สก. ใช้บัตรเลือกตั้งสีชมพู โดยมีการจัดเตรียมตะกร้าในลักษณะเดียวกัน

จากนั้นเวลา 17.15 น. เจ้าหน้าที่ได้ตัดตัวล็อกหีบบัตรเลือกตั้งทั้ง 4 มุม และเริ่มนำบัตรออกมาขานนับคะแนน โดยในช่วงแรกของการนับคะแนนผู้ว่าฯ กทม. (บัตรสีเขียว) พบว่า บัตรดีเบอร์ 9 นายชัชชาติ สิทธิพันธุ์ ได้รับการขานคะแนนอย่างต่อเนื่อง รองลงมาคือเบอร์ 14 นางมัลลิกา บุญมีตระกูล มหาสุข ผู้สมัครอิสระ ตามด้วยเบอร์ 5 นายอนุชา บูรพชัยศรี (เจมส์) พรรคประชาธิปัตย์ และเบอร์ 10 นายชัยวัฒน์ สถาวรวิจิตร (ดร.โจ) พรรคก้าวไกล

กระทั่งนับคะแนนเสร็จสิ้นและมีการตรวจสอบความถูกต้อง พบว่า ผลคะแนนผู้ว่าฯ กทม. เป็นดังนี้
เบอร์ 9 นายชัชชาติ สิทธิพันธุ์ ได้ 164 คะแนน
เบอร์ 14 นางมัลลิกา บุญมีตระกูล มหาสุข ได้ 46 คะแนน
เบอร์ 5 นายอนุชา บูรพชัยศรี ได้ 22 คะแนน
เบอร์ 10 นายชัยวัฒน์ สถาวรวิจิตร ได้ 19 คะแนน

ขณะที่ช่วงแรกของการนับคะแนนสมาชิกสภากรุงเทพมหานคร (สก.) บัตรสีชมพู พบว่า เบอร์ 2 น.ส.ศศิธร ประสิทธิ์พรอุดม กลุ่มเพื่อไทย Life ลงตัว (อดีต สก. ปี 65 สังกัดพรรคเพื่อไทย) ได้รับการขานคะแนนอย่างต่อเนื่อง ตามด้วยเบอร์ 4 นายธีรกร ไหวดี ทีมคนทำงาน เบอร์ 5 นายอดิเจษฎ์ ประยูรพฤกษ์ พรรคประชาชน และเบอร์ 3 น.ส.นัชธนัญญ์ ทรัพย์ญาณกรณ์ พรรคประชาธิปัตย์

เมื่อสิ้นสุดการนับคะแนนและตรวจสอบความถูกต้อง พบว่า ผลคะแนน สก. เป็นดังนี้
เบอร์ 2 น.ส.ศศิธร ประสิทธิ์พรอุดม ได้ 80 คะแนน
เบอร์ 4 นายธีรกร ไหวดี ได้ 70 คะแนน
เบอร์ 5 นายอดิเจษฎ์ ประยูรพฤกษ์ ได้ 52 คะแนน
เบอร์ 3 น.ส.นัชธนัญญ์ ทรัพย์ญาณกรณ์ ได้ 38 คะแนน