สำนักงาน ป.ย.ป. เป็นหน่วยงานกลางในการประสานบูรณาการขับเคลื่อนยุทธศาสตร์ชาติ ผ่านกลไกกลุ่ม ป.ย.ป. กระทรวงในการขับเคลื่อนแผนแม่บทภายใต้ยุทธศาสตร์ชาติของแต่ละกระทรวง โดยเฉพาะในกรณีที่เกิดปัญหาการดำเนินการที่ต้องมีการบูรณาการระหว่างหน่วยงานหลายหน่วย หรือการแก้ไขปัญหาที่ซับซ้อนเชื่อมโยงหลายหน่วยงาน โดยให้สำนักงาน ป.ย.ป. ประสานงานระหว่างกลุ่ม ป.ย.ป. กระทรวง และหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง เพื่อร่วมกันหาแนวทางแก้ไขปัญหานำเสนอคณะกรรมการขับเคลื่อนการปฏิรูปประเทศ ยุทธศาสตร์ชาติ และการสร้างความสามัคคีปรองดอง (คณะกรรมการ ป.ย.ป.) และคณะรัฐมนตรีพิจารณา อันจะทำให้การขับเคลื่อนยุทธศาสตร์ชาติและแผนแม่บทภายใต้ยุทธศาสตร์ชาติเห็นผลในระยะเวลาที่รวดเร็วขึ้นบรรลุและเป้าหมายอย่างมีประสิทธิภาพ ​

เมื่อวันที่ 30 พฤศจิกายน 2565 สำนักงาน ป.ย.ป. ได้มีการจัดประชุมเชิงปฏิบัติการเพื่อสร้างการรับรู้และเสริมสร้างประสิทธิภาพในการขับเคลื่อนยุทธศาสตร์ชาติสำหรับกลุ่ม ป.ย.ป. กระทรวง ณ โรงแรม เดอะ เบอร์เคลีย์ ประตูน้ำ กรุงเทพมหานคร เพื่อสร้างการสร้างรับรู้ รูปแบบ และแนวทางการติดตามขับเคลื่อนโครงการ ในปีงบประมาณ พ.ศ. 2566 ตามแนวทางของสำนักงาน ป.ย.ป. ซึ่งสำนักงาน ป.ย.ป. ได้พิจารณาคัดเลือกโครงการ 3 รูปแบบ อาทิ โครงการที่ได้รับงบประมาณสูงสุดในทุกแผนแม่บทภายใต้ยุทธศาสตร์ชาติ/แผนปฏิบัติการภาค 6 ภาค โครงการที่ส่งผลกระทบในวงกว้าง และโครงการที่หน่วยงานเจ้าของโครงการมีความประสงค์จะให้สำนักงาน ป.ย.ป. ร่วมติดตามขับเคลื่อน โดยนายกรัฐมนตรีได้มีบัญชาให้สำนักงาน ป.ย.ป. ร่วมกับสำนักงานสภาพัฒนาการเศรษฐกิจและสังคมแห่งชาติ (สศช.) ติดตามขับเคลื่อนโครงการสำคัญประจำปี พ.ศ. 2566 ที่ส่งผลต่อการบรรลุเป้าหมายยุทธศาสตร์ชาติ และแผนแม่บทภายใต้ยุทธศาสตร์ชาติ จำนวน 105 โครงการ คิดเป็นร้อยละ 25 ของจำนวนโครงการทั้งหมด แผนงานโครงการภายใต้แผนปฏิบัติการภาค 6 ภาค จำนวน 5 โครงการ และโครงการกิจกรรมตามแผนปฏิรูปประเทศที่คณะกรรมาธิการติดตามเสนอแนะ และเร่งรัดการปฏิรูปประเทศ และการจัดทำและดำเนินการตามยุทธศาสตร์ชาติ วุฒิสภา (คณะกรรมาธิการ ตสร. วุฒิสภา) เห็นควรติดตามเร่งรัดให้เกิดผลเป็นรูปธรรม จำนวน 51 โครงการ รวมทั้งสิ้น 105 โครงการ การติดตามขับเคลื่อนโครงการฯ ไตรมาส 3 ประจำปีงบประมาณ พ.ศ. 2566 ระหว่างวันที่ 1-15 สิงหาคม 2566 สำนักงาน ป.ย.ป. ร่วมกับกลุ่ม ป.ย.ป. กระทรวง และหน่วยงานเจ้าของโครงการ ติดตามขับเคลื่อนโครงการผ่านการประชุมทางสื่ออิเล็กทรอนิกส์เพื่อลดข้อจำกัดด้านเวลา ค่าใช้จ่าย และอำนวยความสะดวกในการเข้าร่วมประชุม รวมทั้งสามารถบริหารจัดการเวลาให้สามารถติดตามโครงการสำคัญจำนวนมากได้ในระยะเวลาที่กำหนด ผลการติดตามขับเคลื่อนโครงการฯ พบว่า โครงการส่วนใหญ่เป็นโครงการที่มาจากนโยบายระดับชาติ คิดเป็นร้อยละ 62 รองลงมาเป็นโครงการที่มาจากความต้องการของพื้นที่เพียงร้อยละ 10 เท่านั้น โดยการดำเนินโครงการส่วนใหญ่เป็นการดำเนินงานในลักษณะที่เป็นภารกิจประจำหรือเกี่ยวข้องกับการดำเนินงานปกติของหน่วยงาน ซึ่งหน่วยงานสามารถดำเนินการได้เองภายในหน่วยงาน จึงไม่จำเป็นต้องมีการบูรณาการระหว่างหน่วยงาน ในส่วนของโครงการที่ต้องมีการบูรณาการระหว่างหน่วยงานจากการดำเนินโครงการสำคัญในปีงบประมาณ พ.ศ. 2566 ให้บรรลุเป้าหมายตามแผนแม่บทฯ ซึ่งเป็นการเพิ่มการทำงานอย่างบูรณาการของภาครัฐมากขึ้น จากการติดตามขับเคลื่อนโครงการยังมีหลายโครงการที่พบประเด็นปัญหาในการดำเนินโครงการ โดยในแต่ละโครงการอาจพบปัญหามากกว่า 1 ประเด็น ซึ่งปัญหาส่วนใหญ่จะเป็นปัญหาด้านการเงิน/งบประมาณ รองลงมาเป็นด้านการปฏิบัติงาน ด้านบุคลากร ด้านกฎหมาย ระเบียบ และข้อบังคับตามลำดับ

อีกทั้งยังมีปัจจัยที่เป็นความเสี่ยงในการดำเนินโครงการ เช่น การขออนุญาตใช้พื้นที่ของหน่วยงานอื่นก่อน การดำเนินโครงการ/การก่อสร้าง โดยเฉพาะงานที่มีความเกี่ยวข้องกับการรื้อถอนสิ่งก่อสร้างหรือย้ายสาธารณูปโภค เป็นต้น นอกจากนี้สำนักงาน ป.ย.ป. ดำเนินการนำร่องในการขับเคลื่อนประเด็นปัญหาและขยายผลโครงการสำคัญในประเด็นที่สำนักงาน ป.ย.ป. สามารถประสานการขยายผลในช่วงเวลาจำกัด ในไตรมาสที่ 4 ให้เกิดผลการดำเนินงานที่เป็นรูปธรรมร่วมกับหน่วยงานเจ้าของโครงการ และหน่วยร่วมบูรณาการ เช่น การบูรณาการแพลตฟอร์มการบริการล่ามภาษามือทางไกล และคำบรรยายแทนเสียง สำหรับสนับสนุนการเรียนการสอนผู้เรียนที่พิการทางการได้ยินในระดับมัธยมศึกษาและอุดมศึกษา ร่วมกับสำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ การขยายผลการใช้ AI สำหรับการแจ้งเตือนการรุกล้ำแนวเขตแม่น้ำ ลำคลอง และแหล่งน้ำธรรมชาติ ร่วมกับมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ เป็นต้น และหน่วยร่วมบูรณาการ เช่น การบูรณาการแพลตฟอร์มการบริการล่ามภาษามือทางไกล และคำบรรยายแทนเสียง สำหรับสนับสนุนการเรียนการสอนผู้เรียนที่พิการทางการได้ยินในระดับมัธยมศึกษาและอุดมศึกษา ร่วมกับสำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ การขยายผลการใช้ AI สำหรับการแจ้งเตือนการรุกล้ำแนวเขตแม่น้ำ ลำคลอง และแหล่งน้ำธรรมชาติ ร่วมกับมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ เป็นต้น

​นอกจากนี้ในวันที่ 9 สิงหาคม 2566 สำนักงาน ป.ย.ป. ได้ร่วมกับกลุ่ม ป.ย.ป. กระทรวง จัดประชุมเชิงปฏิบัติการเพื่อติดตามขับเคลื่อนโครงการสำคัญตามแผนแม่บทภายใต้ยุทธศาสตร์ชาติโดยกลุ่ม ป.ย.ป. กระทรวง ณ สำนักงาน ป.ย.ป. เพื่อปรับปรุงแนวทางในการติดตามขับเคลื่อนโครงการฯ ไตรมาส 4 ระหว่างวันที่ 1-15 กันยายน 2566 และร่วมแลกเปลี่ยนความคิดเห็นแนวทางในการขับเคลื่อนและติดตามประสานงานภายใต้ประเด็นสำคัญร่วมกันของเจ้าหน้าที่สำนักงาน ป.ย.ป. อย่างมีประสิทธิภาพมากยิ่งขึ้นในระยะต่อไป ตลอดจนสำนักงาน ป.ย.ป. มีการจัดสัมมนาเชิงปฏิบัติการเพื่อเสริมสร้างศักยภาพการปฏิบัติงานแบบบูรณาการของกลุ่ม ป.ย.ป. กระทรวง ในวันที่ 29-30 สิงหาคม 2566 ณ จังหวัดสมุทรสงคราม เพื่อแลกเปลี่ยนความคิดเห็น ประสบการณ์การทำงานระหว่างกลุ่ม ป.ย.ป. กระทรวง ตลอดจนปัญหา ข้อเสนอแนะและแนวทางการขับเคลื่อนยุทธศาสตร์ชาติ เพื่อก้าวไปสู่ Partnership for Success เสริมสร้างความสัมพันธ์ที่ดีในการประสานการทำงานร่วมกัน รวมทั้งเพิ่มทักษะ Design thinking แก่ผู้เข้าร่วมกิจกรรม