เมื่อวันที่ 13 พฤษภาคม 69 ผู้สื่อข่าวรายงานว่า กระทรวงวัฒนธรรมและศิลปกรรมแห่งราชอาณาจักรกัมพูชา ได้ออกหนังสือประท้วงอย่างรุนแรง และปฏิเสธการตัดสินใจของกรมศิลปากรไทย กรณีขึ้นทะเบียนโบราณสถานเพิ่มเติม ซึ่งรวมถึงปราสาทตาเมือน ปราสาทตาควาย ปราสาทคนา และโบราณสถานอื่น ๆ บริเวณชายแดน โดยฝ่ายกัมพูชาระบุว่า โบราณสถานดังกล่าวตั้งอยู่ภายใต้อำนาจอธิปไตยของราชอาณาจักรกัมพูชา
แถลงการณ์ของกระทรวงวัฒนธรรมและศิลปกรรมกัมพูชา ระบุว่า การดำเนินการฝ่ายเดียวของไทยถือเป็นการกระทำที่ผิดกฎหมาย เป็นโมฆะ และไม่มีผลทางกฎหมายใด ๆ พร้อมยืนยันว่าการขึ้นทะเบียนดังกล่าวปราศจากมูลความจริง และไม่สามารถใช้เป็นหลักฐานอ้างสิทธิอธิปไตยเหนือดินแดน หรือใช้เป็นเครื่องมือกำหนดเขตแดนได้ในทุกกรณี
นอกจากนี้ กระทรวงวัฒนธรรมฯ กัมพูชา ยังเรียกร้องให้รัฐบาลไทยถอนการขึ้นทะเบียนดังกล่าวโดยทันที และงดเว้นการดำเนินการฝ่ายเดียวที่อาจส่งผลกระทบต่อความพยายามในการแก้ไขปัญหาอย่างสันติผ่านกลไกทวิภาคี
ขณะที่ชาวบ้านในพื้นที่ จ.บุรีรัมย์ ต่างออกมาแสดงความคิดเห็นต่อกรณีดังกล่าว โดยนางสมบูรณ์ ช่างเกวียน อายุ 68 ปี แม่ค้าขายพิซซ่า ชาว อ.บ้านด่าน จ.บุรีรัมย์ กล่าวว่า ในฐานะคนไทย ไม่เห็นด้วยกับการที่กัมพูชาออกหนังสือประท้วงการขึ้นทะเบียนโบราณสถานของกรมศิลปากร เพราะมองว่าปราสาทดังกล่าวอยู่ในพื้นที่ของประเทศไทยมาอย่างยาวนาน พร้อมยืนยันว่าคนไทยไม่ยอมอย่างแน่นอน
ด้านนางเปย์ จันทา อายุ 62 ปี ช่างเย็บผ้า กล่าวว่า ตนเชื่อว่าปราสาทดังกล่าวเป็นพื้นที่ของประเทศไทย และไม่เข้าใจเหตุผลที่กัมพูชาต้องออกหนังสือประท้วง พร้อมระบุว่าไม่อยากให้กรมศิลปากรยกเลิกการขึ้นทะเบียนโบราณสถาน เพราะเกรงว่าจะทำให้กัมพูชาได้ใจและเกิดความเคยชินต่อการคัดค้านในลักษณะดังกล่าว
